---
title: "Molecular dynamics · Aklatan · Hypothesis ng Simulasyon"
url: https://simulation-hypothesis.com/fil/library/molecular-dynamics
description: "Ang molecular dynamics ay paraan ng pagsisimulate ng mga atom at molekula sa kompyuter."
license: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
credit: "Ross Allan Dahl, Hypothesis ng Simulasyon (simulation-hypothesis.com)"
---

## Pisika at computation

# Molecular dynamics

Depinisyon

Ang molecular dynamics ay paraan ng pagsisimulate ng mga atom at molekula sa kompyuter. Pinauusad nito ang mga equation ni Newton gamit ang empirikal na force field, kadalasan sa mga femtosecond na timestep. Ito ang pangunahing kasangkapan ng computational chemistry.

Sa site na ito

Ginagamit ng baitang na Atom ang karaniwang all-atom na numero na mga isang libong operasyon bawat atom bawat femtosecond na hakbang.

Papel sa modelo

Ginagamit ng baitang na Atom ang mga operasyon bawat atom bawat femtosecond na talagang ginagamit ng mga kimiko kapag nagsisimulate ng protina. Ang pagkakaiba ay sukat. Nagsisimulate sila ng milyon-milyong atom sa loob ng mga microsecond. Isang buong planeta sa loob ng isang siglo ang hinihingi ng sandbox.

Kaugnay

[Katumpakan ng materya](https://simulation-hypothesis.com/fil/library/matter-fidelity)[Timestep](https://simulation-hypothesis.com/fil/library/timestep)

Sa mga puno

[Molecular dynamics · Mga Simulasyon](https://simulation-hypothesis.com/fil/trees/simulations?n=m-md)[Mga likidong hard-sphere · Mga Simulasyon](https://simulation-hypothesis.com/fil/trees/simulations?n=mat-hard)

## Ang mga tao sa likod ng mga termino

14 maikling pahina, isa bawat palaisip, bawat isa ay may katugmang dial. Tingnan din ang [listahan ng babasahin](https://simulation-hypothesis.com/fil/reading).

[Ang yungib ni Plato](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/plato)[Ang paruparo ni Zhuangzi](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/zhuangzi)[Ang panaginip ni Vasubandhu](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/vasubandhu)[Ang māyā ni Shankara](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/shankara)[Ang pagdududa ni al-Ghazali](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/ghazali)[Ang imahinasyon ni Ibn Arabi](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/ibn-arabi)[Ang buhay ay panaginip ni Calderón](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/calderon)[Demonyo ni Descartes](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/descartes)[Ang nakadarama ni Berkeley](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/berkeley)[Ang bilog na mga guho ni Borges](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/borges)[Ang experience machine ni Nozick](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/nozick)[Brain in a vat ni Putnam](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/putnam)[Trilemma ni Bostrom](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/bostrom)[Chalmers: totoo ang mga virtual na mundo](https://simulation-hypothesis.com/fil/thinkers/chalmers)