분자동역학

분자동역학은 컴퓨터에서 원자와 분자를 시뮬레이션하는 방법이에요. 경험적 힘장으로 뉴턴 방정식을 한 단계씩 진행시키고, 보통 펨토초 시간 단계를 써요. 계산화학의 주력 도구예요.

원자 단계는 원자당 펨토초 단계마다 약 천 번 연산이라는 표준 전원자 값을 써요.

원자 단계는 화학자들이 단백질을 시뮬레이션할 때 실제로 쓰는 원자당 펨토초당 연산 수를 써요. 차이는 규모예요. 그들은 수백만 개의 원자를 마이크로초 동안 시뮬레이션해요. 샌드박스는 행성 전체를 한 세기 동안 요구해요.