Dinámica molecular
La dinámica molecular es una manera de simular átomos y moléculas en una computadora. Avanza las ecuaciones de Newton con campos de fuerza empíricos, normalmente en pasos de tiempo de femtosegundos. Es el caballo de batalla de la química computacional.
El peldaño Átomo usa la cifra estándar de simulación con todos los átomos: unas mil operaciones por átomo y por paso de femtosegundo.
El peldaño Átomo usa las operaciones por átomo y por femtosegundo que los químicos usan de verdad al simular una proteína. La diferencia es la escala. Ellos simulan millones de átomos durante microsegundos. El sandbox pide un planeta entero durante un siglo.
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